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25年首期线下相聚广州 开启单细胞数据挖掘之旅

hqy hqy 发表于2025-03-03 06:11:18 浏览10 评论0百度已收录

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新年新气象

转眼2025年啦,咱们的线下和线上课程也紧锣密鼓的开始啦!

千呼万唤,让我们广州线下约起

生信入门&数据挖掘线上直播课3月班

去年24年,咱们的线下在南京、广州以及长沙与大家一起相聚学习,今年肯定会去到更多的地方!希望和大家在不同的地方一起学习一起进步!

之前在南京线下已经整理过相关的课程笔记了,但是肯定是不及课程十分之一的精彩。具体的课程期待大家来亲自体会!

关于线下课

咱们的线下课是以单细胞数据挖掘为主题,包含了周末两天的线下面对面授课+线上三周的直播课程!

Day1——R语言基础(单细胞定制版)

因为是以单细胞为主,所以咱们在第一天学习的时候,虽然是R语言基础,但是呢会夹带不少单细胞的干货!

比如在数据格式部分,就是以单细胞实际数据为例子讲解了矩阵,单细胞表达矩阵在使用对应的函数读取

还以读取的数据以及创建好的seurat对象为例子,讲解了特殊的数据结构之狭义的对象

其余的内容简介可以看看之前的笔记——单细胞数据挖掘-南京站Day1

不过大家可能也会疑问,为什么我想学单细胞还得先学R语言呢?借用小洁老师很喜欢的一句话就是——基础不牢地动山摇!

不论是学习转录组、单细胞或者是别的分析,都是需要有R语言或者别的编程语言的基础!——学单细胞前为啥要学R语言?

所以咱们的课程安排,第一天就是围绕着单细胞方向专门定制版的R语言基础!

Day2——单细胞系统学习+文献复现

在R语言里面分析单细胞,咱们主要用到的是Seurat包,所以会介绍基于seurat包进行单细胞数据分析的全过程!

在单细胞分析中,主要限速步骤可能就是最后的单细胞亚群注释啦,亚群注释需要我们有一些关于样品的背景知识,熟悉并背诵一些常见的marker基因,当然在最开始我们也可以借助在线注释网站,或者自动注释软件辅助注释一下!

并且结合了#单细胞常见图表合集中的可视化及美化方式,讲解常用的可视化marker基因的方式!

掌握好基础之后,就可以开始尝试一些实战分析啦,所以下午是结合一篇文献复现,从数据下载整理读取,到降维聚类分群再到最终的可视化,将单细胞分析流程串联起来学习!

单细胞实战数据资料大放送——学了整个流程之后,要多练习才会熟能生巧!所以会提供练习数据集给到大家!

线上数据挖掘系统入门课

两天时间还是有些紧凑,课后肯定需要时间去消化吸收,如果仅仅是自己理解的话可能会花费较多的时间!

考虑到这点,所以我们是线下两天+线上三周的模式,帮助学员更加轻松的学习理解知识点!

生信入门&数据挖掘线上直播课3月班

期待相聚

2019年咱们团队去了很多很多的地方,24年也开始陆续重启线下课程,那在全新的2025年,我们会争取去到更多的地方,和大家一起线下面对面交流学习!

这一期我们在广州,下一期就可能会是在你所在的城市呀!期待和大家在所在的城市相聚!